El Pavo Real Arlequín es mas una de las mutación del Pavo Real Azul. El gene para el padrón arlequín es de dominancia incompleta e es un alelo del gene para el color blanco.
Los machos arlequines tienen los mismos colores que el Pavo Real Azul, pero con manchas blancas en el plumaje dispersas de forma irregular por el cuerpo del animal.
Así como el Pavo Real Ala Negra, en el Arlequín también tenemos una mutación del padrón. Todos los colores que surgen en el Pavos Real azul Arlequín son los mismos de la estirpe salvaje, pero organizados de forma distinta.
El Pavo Real arlequín no resulta del cruce entre el Pavo Real Azule e el Blanco, los arlequines han surgido porque el gene para el color e padrón de la estirpe salvaje (azul de hombros rallados) sufrido naturalmente, una mutación.
Un buen ejemplar es aquel que tiene un gran porcentaje de plumaje blanco e que esta se encuentre distribuida simétricamente en su cuerpo. Es también deseable que tengan plumas blancas en la cola.